我在一个工厂里面上了差不多二十多天几天班，现在辞工了，工厂里面说工资要扣两个月，这样怎么办，

法律分析：劳动者辞职到期，用人单位克扣其工资的，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉或者申请劳动仲裁。
一、如果是给用人单位工作，有两个途径可以要求支付工资：
1、劳动者可以到当地劳动局劳动监察投诉；
2、可以到当地劳动局（人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会）申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金
二、如果是给个人工作，不算劳动关系，可以直接去法院起诉该个人老板，要求支付劳动报酬。法律依据： 《中华人民共和国劳动合同法》 第八十五条 用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的;
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;
(三)安排加班不支付加班费的;
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

拖欠或扣发工资，职工可以和单位协商解决。
协商不成的，职工可以向当地的区县级劳动仲裁院（劳动仲裁院设在人力资源社会保障局）申请仲裁，要求补发工资。

因为在你辞职之前是需要进行相应的交接的，所以交接以后再出现任何问题都跟你没有关系了。
你们老板如果可扣你工资，你就可以去当地的人力资源和社会保障局投诉他。