在荒地上种植了十多年，从最初的木薯、花生到今天的果树，突然被村经济合作社告知，被定义为村霸，占用村集体土地，要求清除果树，并赔偿村经济合作社每年1000元/亩。农民该怎么办？

你好 ，发生土地征用纠纷问题可以向上一级政府部门投诉或直接向法院起诉维护村民的合法权益，必要时考虑委托专业的律师帮忙处理，能更好维护您的合法权益。

农户有权向国土资源部门反映，或向公安机关举报，追究非法占用农用地刑事责任。并赔偿经济损失。村干部不承担责任。禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。已经办理审批手续的非农业建设占用耕地，一年内不用而又可以耕种并收获的，应当由原耕种该幅耕地的集体或者个人恢复耕种，也可以由用地单位组织耕种；一年以上未动工建设的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳闲置费；连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。法律依据：《中华人民共和国土地法》第三十八条　禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。已经办理审批手续的非农业建设占用耕地，一年内不用而又可以耕种并收获的，应当由原耕种该幅耕地的集体或者个人恢复耕种，也可以由用地单位组织耕种；一年以上未动工建设的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳闲置费；连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。
在城市规划区范围内，以出让方式取得土地使用权进行房地产开发的闲置土地，依照《中华人民共和国城市房地产管理法》的有关规定办理。

农村包地种养村委可能会收费。
1、如果农户想在本地荒地上搞开发利用，就必须先到所属组咨询了解权属所在，若没有分包给别人，属于组集体的，需要和组集体签订协议，属于村集体的，需要和村集体签订协议，协商承包开发事宜。需要注意的是，村组集体财产承包，需要经过本村组村民或村民代表会议通过，这样就可以合理合法的开发利用了。
2、至于在本村荒地上种植林木和果树是否缴纳相关费用，应该在协议中明确说明，一般都是象征性缴纳适度的承包费即可，同时还要明确的包括四至范围，承包开发使用的年限，到期后移交事宜。总的来说，农民在本村的荒地上种植林木和果树，要不要缴纳承包费不好说，具体看你跟村组签订的协议，如果明确了就需象征性的交点费用。
法律依据：《农村土地承包法》第5条规定：
农村集体经济组之成员有权依法承包由本集体经济组织发包的土地。任何组织何个人不得剥夺和非法限制农村集体经济组织成员承包土地的权利。”该条规定中的“农村集体经济组织成员”之前并没有特殊的限定语，这意味着只要是农村集体经济组织的成员，有能力和意愿承包本集体经济组织的土地，任何人无权干涉。