今天我向上级申请休息一天，上级未同意，算我旷工，然后我就说随便，他就叫我明天去公司办理工作交接，算我自动离职，这样我能拿到全部工资吗？

劳动者请病假，应当提交指定医疗机构病假证明，是法律法规和用人单位规章制度的规定，不提交病假条，用人单位制度规定算旷工的，可以按旷工处理。劳动部《劳动保险条例实施细则》第二十一条工人职员疾病或非因工负伤需要停止工作医疗者，须经负责医疗机关提出证明，如当时无法取得上项证明，须由工会小组长或小组劳动保险干事证明，始得享受劳动保险待遇。
病愈复工时，应取得负责医疗机关提出能工作的证明。

根据劳动法规定的，如果是自动辞职的，假如用人单位有以下“劳动者解除劳动合同，用人单位应当支付经济补偿金的”，就需要支付经济补偿金，否则就不需要支付。
用人单位需向劳动者支付经济补偿金情形，依据《劳动合同法》的规定，如下几种情形下，用人单位需向劳动者支付经济补偿金：
劳动者解除劳动合同，用人单位应当支付经济补偿金的有11种情形：
1、用人单位未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件，劳动者解除劳动合同的;
2、用人单位未及时足额支付劳动报酬，劳动者解除劳动合同的;
3、用人单位低于当地最低工资标准支付劳动者工资，劳动者解除劳动合同的;
4、用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险费，劳动者解除劳动合同的;
5、用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益，劳动者解除劳动合同的;
6、用人单位以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使劳动者在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同，致使劳动合同无效，劳动者解除劳动合同的;
7、用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利，致使劳动合同无效，劳动者解除劳动合同的;
8、用人单位订立劳动合同违反法律、行政法规强制性规定，致使劳动合同无效，劳动者解除劳动合同的;
9、用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动，劳动者解除劳动合同的;
10、用人单位违章指挥、强令冒险作业危及劳动者人身安全，劳动者解除劳动合同的;
11、法律、行政法规规定的其他情形。

员工主动申请离职的，用人单位应当将劳动者的工资足额发放。
《劳动合同法》中有明确规定，员工离职时办理完所有的离职交接手续后，公司应在手续办理完毕当日给员工核发所有工资。
同时，《劳动合同法》还规定，劳动报酬只要在劳动者实际参加了劳动就应该获得，合同解除或者终止后不影响合同履行期内劳动者的劳动报酬获得。