公司规定迟到一分钟扣一块钱，迟到超过60分钟的话，会在扣60块的基础上再扣负激励100，是否合理？

迟到一分钟扣100工资不合法。
用人单位对于迟到的员工进行扣除相应的工资是不符合法律规定的。但是在员工无正当理由迟到，因为迟到导致用人单位经济损失的，此时，用人单位就可以对员工的工资进行惩罚性的扣除，除此之外，劳动者还应当赔偿损失，用人单位也可以与劳动者解除劳动合同。
劳动合同，又称劳动契约、劳动协议。劳动合同是调整劳动关系的基本法律形式，也是确立劳动者与用人单位劳动关系的基本前提，在劳动法中占据核心的地位。
凡是具有劳动能力，以从事劳动获取合法收入作为生活资料来源的公民都可称为劳动者。
不同的学科对于劳动者这一概念具有不同的界定，而且在不同的社会制度和社会体制下，关于劳动者概念的理解也各不相同。法律依据：《中华人民共和国劳动法》第九十一条 用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
第四十六条 工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。
工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控。
第四十七条 用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。
第四十八条 国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。
用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。

公司按迟到分钟数扣钱合法，但所扣工资必须少于劳动者当月工资的20%。用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
(1)用人单位代扣代缴的个人所得税;
(2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
(3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;
(4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。法律依据：《工资支付暂行规定》第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

迟到，属于缺勤，只是缺勤的时间较短，迟到的时间没有劳动，不发给报酬符合法律规定。无正当理由迟到，因为迟到导致用人单位经济损失的，劳动者还应当赔偿损失。
对迟到工资的具体扣发，法律没有明确规定，可由用人单位依法制定的规章制度规定。
对迟到工资的具体扣发，法律没有明确规定，可由用人单位依法制定的规章制度规定。
对于公司规定迟到一分钟5块钱是否合法的问题，如果该公司的规章制度中，有迟到罚款这样的规定，且该公司的规章制度是经过民主程序制度，即制定颁布程序是合法，只要罚款的数额不超过法律规定的必要限度，就是合法的。
对于公司规定迟到一分钟5块钱是否合法的问题，如果该公司的规章制度中，有迟到罚款这样的规定，且该公司的规章制度是经过民主程序制度，即制定颁布程序是合法，只要罚款的数额不超过法律规定的必要限度，就是合法的。法律依据：《中华人民共和国劳动法》第九十一条?用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
《中华人民共和国劳动法》第九十一条?用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。