办理农村房屋房产证的流程如下:1、填写农村村民建房用地申请审批表;2、收集相关的证件材料后,向当地房屋管理所提交;3、等待房屋管理所受理,并进行公告、审核;4、缴纳费用;5、等待发证。法律依据:《
民法典》第二百零九条不动产
物权的设立、变更、转让和消灭,经依法登记,发生效力;未经登记,不发生效力,但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然
资源,所有权可以不登记。第二百一十条不动产登记,由不动产所在地的登记机构办理。国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法,由法律、行政法规规定。