我请病假，可是主管不让我请假，而且还要算我旷工，我有什么保护自己的方法吗？

不合法。关于旷工扣款这个要看公司规章制度是如何规定的，每个单位情况不一样，以实际情况为准。而且规章制度必须经过了民主程序，必须公示。劳动法和劳动合同法都没有对旷工行为如何处理的规定，只是规定对员工违反企业规章制度的违纪行为企业有权做出相应的处理，单位的规章制度要经过民主程序进行公示，而且必须是合法有效并且已经送达给员工的，这样才有效。
规章制度对旷工行为概念和发生旷工有明确规定的，按具体的处理规定结合员工的实际旷工行为进行处理。关于违约金和罚金的问题，首先从2008年1月1日后除了培训费和竞业禁止或给单位造成直接经济损失外员工不承担其他违约责任。
还有罚金的问题首先针对旷工当日的工资单位依法不予发放，但是额外扣的罚款就没有依据了。所以综上所述，单位有权决定扣款标准，但是那个旷工每天算三天，额外扣20%是不合法的，只能对旷工当日的工资不予发放，除此之外的扣罚就是没有法律依据的。

涉及情况很多，需要具体情况具体分析。例如：职工病假工资怎么计算？企业应依据劳动法及相关解释：
第五条职工患病，医疗期内停工治疗在6个月以上的，其病假工资按以下办法计发：
(一)连续工龄不满10年的，按本人工资的60%发给;
(二)连续工龄满10年不满20年的，按本人工资的65%发给;
(三)连续工龄满20年及其以上的，按本人工资的70%发给。
职工疾病或非因工负伤连续休假超过6个月的，由企业支付疾病救济费：
①连续工龄不满1年的，按本人工资的40%计发；
②连续工龄满1年不满3年的，按本人工资的50%计发；
③连续工龄满3年及以上的，按本人工资的60%计发。
如果职工请假过长不应当享受带薪年假，具体的情形如下：
1)职工依法享受寒暑假，其休假天数多于年休假天数的；
2)职工请事假累计20天以上且单位按照规定不扣工资的;
3)累计工作满1年不满10年的职工，请病假累计2个月以上的;
4)累计工作满10年不满20年的职工，请病假累计3个月以上的;
5)累计工作满20年以上的职工，请病假累计4个月以上的。