员工本身就有病，与用人单位签订协议(如身体问题与用人单位无关)，法律上签订协议是有效的

员工在职期间患病，如果与用人单位签订过劳动合同，那么无论合同条款有无关于患病的条款，都要按照法律规定保障劳动者的权益。第一，允许劳动者凭医院证明申请病假，时间长短根据病情、病历和医生建议执行。第二，员工生病期间，本着人道主义原则和人文关怀精神，公司领导或有关部门可安排人员进行看望和慰问，可给予员工一定的物质补助。如病情严重，还可以发动公司内部进行捐款。第三，病假期间，原则上要按时发放基本工资并缴纳社保，绩效考核工资、岗位补贴和奖金等则可以根据实际劳动时间和贡献率情况发放。第四，病假期间且合同未到期之前，如员工无重大过错，公司不得以生病为由单方面解除劳动合同等。法律依据：《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第一条为了保障企业职工在患病或非因工负伤期间的合法权益，根据《中华人民共和国劳动法》第二十六、二十九条规定，制定本规定。第二条医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。第三条企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期：(一)实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月;五年以上的为六个月。(二)实际工作年限十年以上的，在本单位工作年限五年以下的为六个月;五年以上十年以下的为九个月;十年以上十五年以下的为十二个月;十五年以上二十年以下的为十八个月;二十年以上的为二十四个月。