我们没有结婚证 有两个孩子 现在我想分开 他不同意签解除同居关系协议怎么办

没有经过登记的婚姻（94年以后的同居），不被法律承认和保护，所以双方当事人也不是合法的婚姻关系。双方之间没有婚姻法所规定的夫妻忠诚义务等法律义务。
一般来说，如果对同居期间子女抚养和财产分割有争议的，可以另外以同居期间析产纠纷或者抚养权纠纷起诉至法院，单纯起诉解除同居关系，法院是不会受理的。

关于没办结婚登记，一方出车祸赔偿金的问题 依据《最高人民法院关于适用＜中华人民共和国婚姻法＞若干问题的解释
（一）》第五条第六条的规定,赔偿金这个老伴没有份的.
现行婚姻法中没有事实婚姻,同居时间再长还是同居关系,不会形成登记婚姻的事实效果.

解 除 同 居 关 系 协 议 书 　　立协议书人： 　　甲方：赵XX，男，汉族，19XX年11月25日，XX县人，住XXX小区，身份证号： 。 　　乙方：姜XX，女，壮族，19XX年7月11日生，XX县人，现住XX坡，身份证号： 。 　　赵XX与姜XX于2007年相识并相爱，后于2008年开始建立同居关系至今。2009年7月16日，姜XX生下一男儿，取名为赵XX，现孩子由男方父母扶养。赵XX确认赵XX系自已非婚生亲生儿子。2010年底，双方感情不和，无法共同生活，故双方协商同意解除同居关系,并就财产及子女扶养达成如下协议，共同遵照履行： 　　
一、解除同居关系后，儿子赵XX归赵XX抚养，姜XX不负担儿子抚养费，儿子依法对外承担的法律责任、大额医疗费等任何费用均由赵XX独自承担。 　　
二、女方享有探视儿子的权利，男方保证女方对子女的探视权，不得无故阻挠。 　　
三、同居期间所购买物品电视机、床垫归女方所有，摩托车由男方所有。 　　
四、同居期间所产生的一切债务由男方承担，女方不承担任何债务。 　　
五、该协议经双方签字后生效。 　　
六、本协议一式二份，双方各执一份。 　　甲方： 　　乙方： 　　二0一一年一月二十五日