农村土地被某公司未经允许占用，如何赔偿

(1)根据《土地管理法》第47条的规定，征地补偿有三大块，即：土地补偿费、安置补助费、青苗补偿费。　　
(2)对于这三项费用的分配：安置补助费、青苗费是直接支付给被征地人的，土地补偿费给村集体。　　
(3)但给村集体的土地补偿费也不是就归集体所有、被征地人一点都得不到了：土地补偿费由村集体统一分配，具体如何分要经村民代表大会决定，但在分配时，或者是所有村民都有权平均分、然后由村里给被征地人另行调配土地;或者是多分配给被征地人一些款项作为补偿、而没有被征地的村民就少分或是不分给所征地的土地补偿费。

以下就是国家占用土地赔偿标准的相关回答。我国规定，市、县人民政府土地行政主管部门应在土地征用批准后三个月内，将征地补偿费用支付给被征用土地的农村集体组织或村民委员会。根据国家占用土地赔偿标准在完成了支付之后，补偿费用管理又成了问题，征地补偿费如何管理?对于补偿费用的管理要分类讨论： 　　
1、土地补偿费 　　由农村集体经济组织或者村民委员会管理，主要用于发展集体经济和改善生产和生活条件，可视土地使用者或者土地承包者对土地的投入情况给予适当补偿。 　　
2、安置补助费 　　谁负责安置，谁管理、使用，不安置的支付给个人。 　　
3、地上附着物补偿费 　　谁拆迁或迁建的，支付给谁;自行拆迁的，支付给附着物的所有者;林木、果树补偿给所有者。 　　
4、青苗补偿费 　　青苗的补偿费支付给所有者。禁止侵占、挪用被征地单位征地补偿费和其他有关费用。 　　
5、对征用承包户的土地补偿 　　征用农业承包户的土地，承包期限在10年以上的，农村集体经济组织和村民委员会可以将土地补偿费的80%支付给土地承包经营者。

我国土地管理法第十三条规定，处理土地纠纷的机关是人民政府和人民法院。因农村责任田划分，宅基地的规划及调整和边界划分而引起的纠纷，属于行政部门处理的争议，而不应属于法院管辖。
遇有此类情况，可向当地人民政府主管部门提出申请，予以解决。
法院受理的土地纠纷有两类：一类是行政案件，另一类是民事案件。
属于行政案件的几种情况：一是因土地权属不明、界限不清引起的土地使用权和所有权争议，可先根据《中华人民共和国土地管理法》第十三条的规定，自行协商，未果的，可由人民政府处理，对人民政府处理结果不服的，可在接到处理决定通知书的30日内向法院起诉;二是人民政府对土地所有权和使用权争议作出处理决定以后，如果对处理结果不服，且未在法定期限内申请复议的，可向人民法院提起行政诉讼;三是非法占用土地建房的，必须由主管机关先行处理，对未经批准或采用欺骗手段骗取批准，非法占用土地(宅基地)的，由乡镇人民政府或县级以上地方人民政府或县级以上地方人民政府土地管理部门依法予以行政处罚，当事人对行政处罚决定不服的，可以在接到处罚决定通知之日起15日内向法院提起行政诉讼。
属于民事案件的土地纠纷：一是土地使用权纠纷;二是土地所有权纠纷;三是土地使用权的出让和转让合同纠纷;四是土地出售、交换、出租抵押合同纠纷。另外不包括林木、林地的所有权和使用权纠纷以及宅基地使用权纠纷，都属于法院受理的民事案件范畴，应到法院民事审判庭起诉。
需要提供相关证据：在发生土地纠纷以后，应及时搜寻、保存证据，包括土地使用权证、房产证和各类合同书等。另外，还应提供历史上对发生争议的土地、宅基地的使用情况。涉及侵权的，还应提交侵权人的具体侵权行为和造成的后果等方面的证据。
如果发生的纠纷经过有关部门处理，则还应提交该部门的处理意见。