工伤期间工资需要在以后的赔偿金里面扣除吗？

不合法；如果被扣款，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

工资个税的计算公式为：应纳税额=（工资薪金所得 －“五险一金”－扣除数）×适用税率－速算扣除数
个税免征额是3500，使用超额累进税率的计算方法如下：
缴税=全月应纳税所得额*税率-速算扣除数
实发工资=应发工资-四金-缴税。
全月应纳税所得额=(应发工资-四金)-3500
扣除标准：个税按3500元/月的起征标准算
如果某人的工资收入为5000元，他应纳个人所得税为：(5000—3500)×3%—0=45(元)。

可申请工伤。
一、先申请工伤认定。单位应自事故伤害发生之日起30日内，受伤害职工在事故伤害发生之日起1年内，可以直接提出工伤认定申请。工伤认定申请应当填写《工伤认定申请表》，并提交：
（1）劳动合同文本复印件或其他建立劳动关系的有效证明；（如果是事实劳动关系，用人单位不承认，则应向劳动争议仲裁委员会申请确认事实劳动关系）。
（2）医疗机构出具的受伤后诊断证明书等。
二、劳动能力鉴定（伤残等级鉴定）。工伤职工停工留薪期满或期内伤情处于相对稳定状态，可提出劳动能力鉴定申请，填写《工伤职工劳动能力鉴定（确认）表》，提交：
（1）工伤认定决定书或《工伤证》的复印件 1份；
（2）被鉴定人的身份证复印件 1份、一寸照片2张；
（3）被鉴定人的病历、诊断证明、理化检验报告、 CT、X光片等诊疗资料的复印件；
（4）其他。
三、工伤待遇。伤残包括：⑴医疗费，⑵住院伙食补助费，⑶护理费，⑷一次性伤残补助金：劳动者月工资×法定月份数（不同的伤残等级月份数不等），⑸一次性医疗补助金：重庆职工平均月工资标准×法定月份数（不同的伤残等级对应不同的月份数），⑹一次性伤残就业补助金或伤残津贴，⑺停工留薪期工资：治疗时间（不同伤情时间不同）×劳动者受伤前12个月平均工资，⑻后续治疗费，⑼残疾辅助器具费，⑽交通费等。
四、协商赔偿不成，用人单位所在地或事故发生地申请劳动争议仲裁、诉讼。 希望我的答复能帮助您！。