男方与女方协议离婚，但在离婚协议上注明无共同财产和房产，无小孩，但是在婚姻存续期间有首付一套房子的二层款，房子是以女方名义购买原。

(一)一方婚前支付了全部房款，该房产属于婚前个人财产，离婚时房屋增值部分及亏损属于房屋产权人，如另一方有参与该房子的装修等支出，构成对该房产的舔附价值，对于装修款，可以作为夫妻共同财产予以分割。
(二)一方婚前支付了所有房款，婚后取得产权证。该房财产权益在婚前签订合同后就已经取得，取得房产证的结果也是婚前订立合同及付款行为所致，所以此情形也应视为婚前个人财产。
(三)双方在婚姻存续期间共同购买房屋，但在离婚时尚未取得产权证。夫妻双方在婚姻存续期间已经签订买卖合同，但还未取得房屋产权证的情况下离婚的，如果夫妻双方作为买受人没有交清全部购房款而没有取得产权证，可以按照《婚姻法解释
(二)》第21条处理，人民法院不宜判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用。当事人取得完全所有权后，有争议的，可以另行向人民法院起诉。如果已经支付了全部房价款，房屋所有权法律关系比较清晰，只需完善权属登记手续，人民法院可将以下情况认定为夫妻共同财产，对房屋权属、分割、补偿问题予以处理：第一，在婚姻存续期间购买的，无论是以夫或妻的名义还是妻共同名义;第二，在婚前以夫妻双方的名义购买;第三，在婚前以夫妻双方的共同财产购买，属于婚前共同财产，财产性质存续到婚后仍为夫妻共同财产。

协议离婚财产分配办法如下：
1、夫妻书面约定婚姻关系存续期间所得的财产归各自所有，一方因抚育子女、照料老人、协助另一方工作等付出较多义务的，离婚时有权向另一方请求补偿，另一方应当予以补偿。
2、离婚时，原为夫妻共同生活所负的债务，应当共同偿还。
共同财产不足清偿的，或财产归各自所有的，由双方协议清偿；协议不成时，由人民法院判决。
3、离婚时，如一方生活困难，另一方应从其住房等个人财产中给予适当帮助。具体办法由双方协议；协议不成时，由人民法院判决。
具体说来，夫妻离婚财产分配原则如下：
(一) 夫妻之间对财产的协议优先；
(二) 男女平等；
(三) 照顾子女和女方权益；
(四) 照顾无过错方；
(五) 照顾付出较多方。
因此对于协议离婚的房产分割可以综上考虑进行确定。

具体到公证处咨询办理，离婚协议，双方签字，办理离婚登记手续后，就有法律效力，无需公证。 最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释
（二） 　第八条 离婚协议中关于财产分割的条款或者当事人因离婚就财产分割达成的协议，对男女双方具有法律约束力。 　　当事人因履行上述财产分割协议发生纠纷提起诉讼的，人民法院应当受理。 　　第九条 男女双方协议离婚后一年内就财产分割问题反悔，请求变更或者撤销财产分割协议的，人民法院应当受理。 　　人民法院审理后，未发现订立财产分割协议时存在欺诈、胁迫等情形的，应当依法驳回当事人的诉讼请求。