您好，我的房子比协议上晚交了三年，当时协议上有违约金额，已付房款的万分之一，但是协议上有一条，更换合同时协议失效，我们交房的时候正式又填写了购房合同，想问一下，这个违约金怎么算？

合同失效包括多种合同失效的情况，我国法律有不同的规定，例如：一般私人借款担保合同失效期为6个月，连带担保为2年，如果超出了这个时间则会作废，如果没有超过则依旧有效，债权人依旧有权利在债务人无力偿还的前提下向担保人追偿。根据《担保法》第二十六条规定，连带责任保证的保证人与债权人未约定保证期间的，债权人有权自主债务履行期届满之日起6个月内要求保证人承担保证责任。
在合同约定的保证期间和前款规定的保证期间，债权人未要求保证人承担保证责任的，保证人免除保证责任。根据《中华人民共和国担保法》(以下简称《担保法》)第十二条规定，同一债务有两个以上保证人的，保证人应当按照保证合同约定的保证份额，承担保证责任。
没有约定保证份额的，保证人承担连带责任，债权人可以要求任何一个保证人承担全部保证责任，保证人都负有担保全部债权实现的义务。已经承担保证责任的保证人，有权向债务人追偿，或者要求承担连带责任的其他保证人清偿其应当承担的份额。

　商品房买卖合同中延期交房违约金的约定，符合合同法第一百一十四条的明文规定，违约金的约定具有法律效力，受到法律保护。
　　相关法律规定：《中华人民共和国合同法》
　　第一百一十四条　当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
　　约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。
　　当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。

购房合同是根据《中华人民共和国合同法》、《中华人民共和国城市房地产管理法》及其他有关法律、法规之规定，买受人和房地产开发企业，在平等、自愿、协商一致的基础上就买卖商品房达成的协议。那么，已签购房协议未签订购房合同如何退房，　　
一、已签购房协议未签订购房合同如何退房　　一般只有以下方法解决：　　
1、委托售楼员进行转卖。
2、找关系与其销售经理协商。
3、以银行贷款资料不具备或其它有关开发商责任的理由据付首付。　　
二、签好购房合同要注意的事　　
1、弄清楚合同中的当事人　　在新房买卖过程中合同签署涉及两个当事方：一为购房者，一个是开发商。　　购房者，即购房合同中的“买受人”，他将要成为房屋产权证上记载的所有人;需要支付房款;一旦违反合同约定，承担违约责任。　　
2、核实房屋状况：在看房的时候从以下几个方面入手了解：房屋建筑状况、房屋小区状况、房屋权利情况。这些情况的核实，有利于你控制好交易的实际成本和风险;违约责任。　　
3、明确交易程序：二手房交易可分为看房、签约、按合同约定明确时间给首付款、过户、交房、给余款几大步骤。这几个步骤需要注意：保留好交易的证据、过户是一定要房产证上所有人都到场才可以过户、在交房时要查看清楚对方是否缴纳清了物业费、水电煤气费;这一点在购房签合同注意事项中是非常需要注意的，如果交易流程有那些都不知道的话，将来在过户的时候会非常麻烦的，有可能为自己带来损失。　　
4、明确违约责任：和卖方要明确严格的违约责任，是双方诚信履行二手房买卖合同的保障。