你好，我想离婚，但是他不同意，我现在也不敢回家，我和他分居有3年了，结婚证在他手里，我能起诉离婚吗？

诉讼离婚流程
1.写民事诉状，第一部分写明原告、被告的姓名、性别、出生年月、民族和住所地，第二部分写诉讼请求a.请求离婚；b.小孩的抚养问题；c.财产依法分割；第三部分写事实与理由，把何时结婚、何时生小孩，因为什么原因离婚等情况写明。诉状最好打印，但最末处必须手签名；
2.到被告住所地所在基层法院（区或县法院）起诉，在立案庭办理立案手续；
3.立案的时候递交民事诉状2份、结婚证、夫妻两人的身份证（至少带上自己的）、小孩的户口或出生证原件，如果有财产需要法院分割，还要带上财产相关证据，如房产证、机动车行驶证等。证据需要交2套复印件（法院案卷中一份，发给对方一份）；
4.立案庭审查后，缴费；
5.将缴费票据与材料交给法院立案庭，回家等通知；
6.法院给你的案子排期开庭，并将诉状副本、证据及其他材料送达给被告，送达被告后，会通知你开庭时间，你需要去法院领取开庭传票；
7.如果对方也同意离婚，法院可能约你们双方去调解（我国民事案件中，调解是必经程序，开庭前不组织你们调解，开庭时也会问你们愿不愿意调解），如果调解成功，则发《民事调解书》，调解分两种，可能调解离婚，也可能做通你们的工作，不离婚，结案；
8.如果调解不成则开庭，开庭时还无法调解的，就会判决，最终发《民事判决书》；
9.判决可能判决离婚，也可能判不离，一般情况下，第一次起诉离婚的，被告不同意离婚，法院会判决不予准许离婚。可以在判决生效6个月后再次起诉离婚。

我国法律规定，男女一方要求离婚的，而另一方不同意的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
1、法院调解
我国人民法院在审理一方不同意离婚的件时，首先应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
(1)重婚或有配偶者与他人同居的;
(2)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的;
(3)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的;
(4)因感情不和分居满二年的;
(5)其他导致夫妻感情破裂的情形。
2、法院判决
法院经过调解后发现，夫妻感情确已破裂，并无和好可能时，法院就可以作出准予当事人离婚的判决。
在实践中，一方不同意离婚的，法院首先是进行调解，第一次诉讼一般是不判决离婚的，半年后当事人才可以再次提起离婚诉讼，一般在第二次判离的可能就大大增强了。

夫妻长期分居多久也不会自动离婚，法律没有类似规定。但夫妻因感情不合分居满两年，法院调解无效，应判决准许离婚。
　　婚姻法：
　　第三十二条　男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
　　人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
　　有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
　　
（一）重婚或有配偶者与他人同居的；
　　
（二）实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；
　　
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改的；
　　
（四）因感情不和分居满二年的；
　　
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
　　一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。
因此，如果一方不同意,还是要通过法院诉讼,并不是分居就自动离婚了。