我在公司签了一份两年合同，想辞职，公司要求提前三个月，并要求签订一份违约合同到1000元，请讲道理？

可以的，劳动者提出解除劳动合同分三种情况：一是，依据劳动合同法第三十七条的规定提出解除劳动合同，只需提前30天（试用期3天）通知用人单位即可，不需要任何理由，也不用单位批准，但用人单位不承担经济补偿。同时这属于个人原因中断就业，辞职后领不到失业金。
二是，依据劳动合同法第三十八条的规定提出解除劳动合同，不用提前30天，也不用批准，可立马走人。而且，用人单位还必须按照劳动合同法第十六条第四十七条的规定，支付每工作一年一个月工资的经济补偿金。
三是，劳动者没有任何依据违法解除劳动合同（不打招呼自动离职），用人单位不但不给经济补偿金，还可依据第九十条的规定，给单位造成损失的要承担赔偿责任。用人单位可以扣工资作为赔偿。

公司未及时足额支付劳动者工资报酬，劳动者解除合同不需要支付违约金。
根据《劳动合同法》
（二）扩规定，公司未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以随时通知用人单位解除合同。因此解除合同，按《劳动合同法》第四十六条
（一）款和第四十七条规定，用人单位应当按照劳动者本单位工作年限每年支付一个月本人工资经济补偿金，满半年不满一年的按一年支付，不满半年的按半年支付。
按照国务院《劳动合同法实施条例》第二十六条规定，用人单位与劳动者约定了服务期，用人单位未及时足额支付工资，劳动者依照劳动合同法第三十八条
（二）款规定解除劳动合同，不属于违反服务期的约定，用人单位不得要求劳动者支付违约金。

甲方违约责任处理规定
1、甲方因不能提供本合同约定的房屋而解除合同的，应支付乙方本合同月租金的两倍作为违约金。
2、如乙方要求甲方继续履行合同的，甲方每逾期交房一日，则每日应向乙方支付月租金
0.5%的滞纳金。
3、由于甲方未及时履行维修义务或情况紧急，乙方组织维修的，甲方应支付乙方费用或折抵租金，但乙方应提供有效凭证。
4、甲方违反本合同约定，提前收回房屋的，应按照合同月租金的两倍向乙方支付违约金，若支付的违约金不足弥补乙方损失的，甲方还应该承担赔偿责任。
5、甲方因房屋权属瑕疵或非法出租房屋而导致本合同无效时，甲方应赔偿乙方损失。
乙方违约责任
1、租赁期间，乙方有下列行为之一的，甲方有权终止合同，收回该房屋，乙方应按照合同月租金的两倍向甲方支付违约金。若支付的违约金不足弥补甲方损失的，乙方还应负责赔偿直至达到弥补全部损失为止。
（1）未经甲方书面同意，将房屋转租、转借给他人使用的；
（2）未经甲方书面同意，拆改变动房屋结构或损坏房屋；
（3）改变本合同规定的租赁用途或利用该房屋进行违法活动的；
（4）拖欠房租累计1个月以上的。
2、在租赁期内，乙方逾期交纳本合同约定应由乙方负担的费用的，每逾期一天，则应按上述费用总额的
0.5%支付甲方滞纳金。
3、在租赁期内，乙方未经甲方同意，中途擅自退租的，乙方应该按合同月租金的两倍向甲方支付违约金。若支付的违约金不足弥补甲方损失的，乙方还应承担赔偿责任。
4、乙方如逾期支付租金,每逾期一日,则乙方须按月租金的
0.5%支付滞纳金。
5、租赁期满，乙方应如期交还该房屋。乙方逾期归还，则每逾期一日应向甲方支付月租金
0.5%
的滞纳金。乙方还应承担因逾期归还给甲方造成的损失。