如果我在公司工作时左手拇指受伤，骨头被机器折断，我该如何向公司申请赔偿？

明确工伤认定的法定情形。根据《工伤保险条例》的规定，发生下列情形可以认定工伤：在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的;工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的;在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的;患职业病的;因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的;在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的;法律、行政法规规定应当认定为工伤的其他情形。
要熟悉工伤申报、认定的相关程序。职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请 职工或其近亲属认为是工伤，用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。
如果员工发生工伤，根据《工伤保险条例》的规定，相关费用由工伤保险基金和用人单位分别承担;而用人单位未为员工缴纳工伤保险的，员工应享受的工伤保险待遇全部由用人单位承担;同时，社会保险行政部门有权责令用人单位限期参加工伤保险，并且补交应当缴纳的工伤保险费。
所以，如果用人单位未为员工办理工伤保险，那么，《工伤保险条例》中规定的员工应享受的工伤保险待遇的相关费用将全部由用人单位承担，对于员工来说，不存在实际上的损失。

1、是工伤，享受工伤待遇。建议先进行工伤认定（单位在一个月内不申请的，劳动者可自己申请），再进行劳动能力等级鉴定，然后申请劳动仲裁要求赔偿。
2、赔偿项目：医疗费、停工留薪工资、一次性伤残（工亡）补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金、伤残津贴、护理费、交通住宿费等等。
3、以上项目需要结合工伤等级、工资、停工留薪期等计算，如需帮助，请来电咨询或者面谈。
4、温馨提示:请勿相信中介黄牛，黄牛收费高且不专业，私下鉴定无效，建议委托专业律师。

处理程序如下：
1.当患方或其近亲属对医疗机构的医疗服务提出争议时，首先向各医疗机构的医疗事故争议受理办公室提出疑议，并出示身份证，填写医疗机构义务提供的《医疗资料封存申请书》，必须双方在场的情况下共同封存医疗资料，封条上必须有患方当事人的签字和医疗机构盖章，封存的医疗资料由医疗机构保管。患方要求复印病历的，根据《医疗事故处理条例》第十条规定：在双方在场的情况下复印客观病历并盖医疗机构证明与原件相符。
　　
2.若患者死亡引起争议的，死者亲近亲属首先向医疗机构医疗事故争议受理办公室提出疑议，并出示身份证，填写医疗机构义务提供的《尸检建议书》，在48小时内由省级具有资质的尸检机构进行尸解，尸解费由要求的一方支付给省级尸检机构，最后责任是谁由谁支付。
　　
3. 若医疗事故争议需鉴定的，由要求鉴定方到卫生局医疗事故争议办公室(医政科)填写《医疗事故争议行政处理申请书》，受理办公室自收到申请之日起10日内进行审查，作出是否受理的决定，并书面通知患方和医方。对符合本条例规定，予以受理，需要进行医疗事故技术鉴定的;患方没有死亡的自作出受理决定之日起5日内将材料交由负责医疗事故技术鉴定工作的州医学会组织鉴定，并书面通知申请人;患者死亡的自作出受理决定之日起5日内将有关材料移送文山州卫生局处理并书面通知申请人。对不符合《医疗事故处理条例》规定，不予受理，并书面通知申请人且说明理由。
　　
4.医疗事故争议解决途径有医患双方协商解决，卫生行政部门调解、人民法院判决等三条途径。
　　
5.医疗机构发生医疗事故的，由卫生局根据医疗事故等级和情节给予警告或责令限期停业整顿或吊销执业许可证，对负有责任的医务人员给予行政处分或者纪律处分，情节严重的由法院依法追究刑事责任。