我2012年11月在宝山租一块500平方米的农田自建设厂房，现属违法建筑要拆卸，但合同书也有大半年，我该如何维护保养是你的权益，政府部门又该赔偿我是多少？

违章建筑的房屋买卖合同是无效的。
根据我国《城市规划法》第40条的规定:违章建筑严重影响城市规划的，由县级以上地方人民政府城市规划行政主管部门责令停止建设，限制拆除或者予以没收；影响城市规划但尚可采取改正措施的，由县级以上地方人民政府城市规划行政主管部门责令限期改正，并处罚款。
可见，违章建筑物的产权在城市规划行政主管部门未作出处理前是不能确定的，当然不允许买卖。

租赁的厂房如果是正常营业中遇到拆迁，赔偿可参考相关法律规定。
　　《中华人民共和国拆迁法》
　　第十七条 作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
　　
(一)被征收房屋价值的补偿;
　　
(二)因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿;
　　
(三)因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
　　市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
　　如果厂房有自建的部分，补偿除了停产停业的补偿外，还有被征收的房屋价值的补偿。如果厂房没有自建的部分，补偿只有停产停业的补偿。赔偿款按照法律规定来计算。
　　第十九条 对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋的价值，由具有相应资质的房地产价格评估机构按照房屋征收评估办法评估确定。
　　第二十三条 对因征收房屋造成停产停业损失的补偿，根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素确定。具体办法由省、自治区、直辖市制定。
　　签合同时要注意以下事项：
　　
1、需与拆迁的单位签合同。
　　
2、赔偿的款项需清楚注明，以及赔偿款给付的方式及时间也需一一列明。
　　
3、赔偿争议的处理办法也需注明。

以重新申请在宅基地建房为例

申请流程与上面基本一致，不同的是乡镇政府初审通过后，还要报县(市、区)住房城乡规划建设主管部门审查，合格后核发乡村建设规划许可证。另外材料准备方面，除了户籍证明等三项，需占用农用地的，要提供村民委员会出具的拟占用农用地的情况说明。