你好，请问，合同还没有到期，公司部门属于总部，不在同一个城市，员工不想去，公司赔偿，怎么算？

按照劳动合同法第四十七条计算:　经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
　　劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
　　本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

1、首先你要弄清楚·公司是不是已经给你办理社会保险，如果办理。则由公司先行垫付，后找社保局进行赔付。
2、如果公司没有办理任何的社会保险，则由公司单方面进行赔付。
工伤的赔偿标准是根据《中华人民共和国工伤保险条例》为根据，进行理赔。
最基本的标准有：一次性医疗保险、一次性伤残赔偿金和就业补助金（辞职的情况下）组成。

劳动仲裁不会影响到您后续找工作的！员工与单位间存在纠纷是很常见的，这并不会影响到员工后续的职业发展的!公司无理由辞退员工，员工是可以申请经济补偿金的。
建立劳动关系后，双方当事人因劳动合同订立、履行、变更、解除发生争议，或者因为劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿等发生劳动纠纷，争议较大双方无法协商解决的，可以去劳动仲裁委员会申请仲裁，那么，就要确定劳动仲裁的流程。
实际中，发生劳动争议申请劳动仲裁时，要按照以下流程：
1、提交申请书
当事人申请劳动仲裁，应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。
2、申请被受理
仲裁委员会在收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的决定，决定受理的，在作出决定之日起五日内会将申诉书副本送达被申请人。
3、开庭审理
仲裁庭在开庭的五日前，会将开庭日期、地点书面通知双方当事人。
注意，对无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，申请人会被撤诉自理，被申请人会被做缺席裁决。
4、仲裁调解
仲裁庭处理劳动争议会先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。调解能达成协议的，仲裁庭根据协议内容制作调解书，反之，仲裁庭会及时裁决。
5、仲裁裁决
仲裁庭裁决劳动争议案件，会在劳动仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。