一家公司注册资金五百万，由两个自然人各占50%股份。我想用公司名义收购这家公司。因两个自然人都只到了部分注册资金，双方都同意以实际出资资本金股全转让我方公司。以后会有什么法律纠纷吗？

1、由于注册手续的费用是按资金多少的百分比来算的，所以注册资金多,注册手续费就贵。虽然工商免费了，税务还是按照注册资金来收印花税的。

2、公司注册资本越高，所承担的民事责任越多。

3、注册资金多寡，一定程度上表示该公司的资本是否雄厚，有没有做大项目的能力，客户有时候会以注册资金作为一种合作上的考虑的;

4、很多竞标项目是要考验公司注册资金的。因为注册资金涉及你公司的资质评定等级，不同等级资质的公司可以获得招投标的工程等级也不同，正如三级建筑资质的企业不能获得500万的工程招投标资格一样;注册资金不到一定规模连参与竞标的资格都没有;

5、很多行业注册时就有注册资金门槛的要求，注册资金不够不能申请注册该行业名的公司。比如劳务派遣公司最低注册资本200万元,没有200万元就不能注册;

6、注册资金50万以上，可申请一般纳税人资格，可以开具增值税发票;

7、注册资金50万以上，银行可办理员工工资卡业务;

8、如果银行贷款给公司，往往也要参考注册资金这个条件。

根据我国公司法律、法规的规定，有限责任公司的股权转让一般要经过如下程序：
一、公司受让股权召开公司股东会，研究收购股权的可行性，分析收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。
二、聘请律师进行律师尽职调查。
三、出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。
四、评估、验资(私营有限公司也可以协商确定股权转让价格)。
五、股权转让的公司召开股东会，并形成股东会决议，免去转让方股东的相关职务，表决比例和表决方式按照原来公司章程的规定进行，参加会议的股东在《股东会决议》上签字盖章。
六、向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决;股东之间转让股权的，不需经过股东会表决同意，只要通知公司及其他股东即可。
股东对股权转让给第三方放弃优先购买权，出具放弃优先购买权的承诺或证明。
七、双方签订股权转让协议，对转让股权的数额、价格、程序、双方的权利和义务做出具体规定，使其作为有效的法律文书来约束和规范双方的行为。

您好！股份有限公司不得收购本公司股份。但是，有下列情形之一的除外：
（一）减少公司注册资本；
（二）与持有本公司股份的其他公司合并；
（三）将股份奖励给本公司职工；
（四）股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持异议，要求公司收购其股份的。
公司因前款第
（一）项至第
（三）项的原因收购本公司股份的，应当经股东大会决议。公司依照前款规定收购本公司股份后，属于第
（一）项情形的，应当自收购之日起十日内注销；属于第
（二）项、第
（四）项情形的，应当在六个月内转让或者注销。
公司依照第一款第
（三）项规定收购的本公司股份，不得超过本公司已发行股份总额的百分之五；用于收购的资金应当从公司的税后利润中支出；所收购的股份应当在一年内转让给职工。