在公司是采取保底加考核的方式，加班工资是根据保底计算的，休假是根据工资总额扣除的，这合法吗？

一般公司员工请假，不会扣双倍工资。具体请假工资按照以下标准发放：　　工伤假工资：职工因工伤，在医疗期间，工资照发。　　产假工资：女职工产假(包括流产假)期间工资照发，并且不得在女性怀孕期、产期、哺乳期降低其工资。　　事假工资：劳动部规定：职工本人结婚或职工的直系亲属死亡，由本单位行政领导批准酌情给予1-3天的婚丧假。如结婚双方不在同一地工作，直系亲属死亡在外需要本人前去料理的，可根据路程远近，另给予路程假。在批准的婚丧假和路程假期间，职工的工资照发。对企业职工的一般事假，由于职工在进行加班加点工作时，可以享受加班加点工资待遇，所以，一律不发给工资。对企业的行政管理人员、工程技术人员、由于他们不享受加班加点工资待遇，所以，这些人员请事假每一季度在两个工作日以内的，工资照发，超过天数的不计发工资。　　机关、事业单位的职工请事假的，工资照发。　　探亲假工资：根据国务院的有关规定，职工有规定的探亲假期间，按照本人的标准工资照发工资。　　相关知识延伸阅读：单位拖欠工资要补偿吗　　关于用人单位拖欠工资如何补偿，原劳动部《违反amp;lt;中华人民共和国劳动法amp;行政处罚办法》规定：用人单位有下列侵害劳动者合法权益之一的，应责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可责令按相当于支付劳动者工资报酬、经济补尝总和的一至五倍支付劳动者赔偿金：　　
(一)克扣或无故拖欠劳动者工资的;　　
(二)拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的;　　
(三)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;　　
(四)解除劳动合同后，未依照法律、法规规定给予劳动者补偿的。

劳动者和用人单位建立劳动关系，用人单位属于餐饮企业，法定假日要求劳动者加班并支付给3倍工资，劳动者拒绝加班，用人单位按旷工处理是不合法的，用人单位不得强迫或者变相强迫劳动者加班。用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。　　劳动者合法权益受到侵害的，有权要求有关部门依法处理，或者依法申请仲裁、提起诉讼。　　《工资支付暂行条例》　　第十八条各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：　　
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；　　
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的；　　
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。　　经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。　　第十九条劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。　　《劳动合同法》　　第七十七条　劳动者合法权益受到侵害的，有权要求有关部门依法处理，或者依法申请仲裁、提起诉讼。　　第七十八条　工会依法维护劳动者的合法权益，对用人单位履行劳动合同、集体合同的情况进行监督。用人单位违反劳动法律、法规和劳动合同、集体合同的，工会有权提出意见或者要求纠正；劳动者申请仲裁、提起诉讼的，工会依法给予支持和帮助。

1、加班费是否需要缴纳社保金？按社保法的规定，员工工资总额就是交社保的基数的。
2、《社会保险法》
第十二条 用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳基本养老保险费，记入基本养老保险统筹基金。
第六十条 用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。社保缴费是指参加各类社保保险并缴纳保费的行为。一般情况下特指社会统筹的养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险的缴费。社保缴费分为两部分：单位缴纳部分和个人缴纳部分。加班费是指劳动者按照用人单位生产和工作的需要在规定工作时间之外继续生产劳动或者工作所获得的劳动报酬。劳动者加班，延长了工作时间，增加了额外的劳动量，应当得到合理的报酬。对劳动者而言，加班费是一种补偿，因为其付出了过量的劳动；对于用人单位而言，支付加班费能够有效地抑制用人单位随意地延长工作时间，保护劳动者的合法权益。