我和公司的领导当面提出退休，领导当场同意，让他们马上打包出去。 然后我去听，再过两天问上司怎么结算工资，上司说和公司的领导商量之后再回复。 下个月过去了，我去公司结算工资，上司说我没有办理公司的离职手续，扣除所有的工资是合法的吗？

在依法办理离职手续后，用人单位必须为出具解除劳动合同证明（即离职证明），同时劳动者的工资、押金和经济补偿是必须结清。用人单位不得随意扣减或者拖欠，当事人可以在办理离职手续时要求结清。否则当事人可以去劳动局申诉或者举报用人单位的违法违规行为。　双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。　　根据《工资支付暂行规定》　　第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。　　根据《中华人民共和国劳动合同法》规定　　第五十条　用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。　　劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。　　用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。　　第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：　　
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；　　
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；　　
(三)安排加班不支付加班费的；　　
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

无故扣工资一般情况下是不允许的，所以大多数公司扣工资的行为是违法的。

我国当前没有明确规定用人单位扣员工工资的法律依据，所以大多是依据公司规章制度来执行，如有争议可先协商。