公司支付雇员保险的理由是公司头三个月没有支付社会保险费,需从雇员的工资中扣除。

1.《劳务派遣暂行规定》在社会保险权益方面，明确劳务派遣单位开展跨地区派遣业务的，应当在用工单位所在地为被派遣劳动者参加社会保险，按照用工单位所在地的规定缴纳社会保险费。
2.具体由哪一方为劳务派遣人员缴纳各项社会保险是由劳务派遣公司和实际用工单位协商确定的。但不管如何约定，劳务派遣单位或用工单位都必须为劳务派遣人员缴纳各项社会保险费，不能互相推脱，侵犯劳务派遣人员的权益。
3.劳务派遣工若出现劳动纠纷，法律明确规定。劳务派遣单位是法定用人单位，应承担法律责任，用工单位承担连带责任。
因此，即使时劳务派遣过程中也应当依法缴纳社会保险，否则劳动者有权要求其进行补缴。

根据法律规定，用人单位有为劳动者缴纳社保的义务，如果单位不交社保，你可以去当地劳动监察部门去投诉。
《社会保险法》第四条　中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。

单位给员工买社保，一般是按照五险一金或三险一金来买，且二者是有区别的。
一、五险一金：
养老保险:单位每个月为你缴纳工资基数的21%,你自己缴纳工资基数的8%;
医疗保险:单位每个月为你缴纳9%,你自己缴纳2%外加3~10块钱的大病统筹(大病统筹主要管住院这块)；
失业保险:单位每个月为你缴纳2%,你自己缴纳1%;
工伤保险:单位每个月为你缴纳
0.5%,你自己一分钱也不要缴;工伤保险根据单位被划分的行业范围来确定它的工伤费率，在
0.5%~2%之间；
生育保险:单位每个月为你缴纳
0.8~1%,你自己一分钱也不要缴;
住房公积金:单位每个月为你缴纳8%,你自己缴纳8%(各地情况不同，根据企业的实际情况，选择住房公积金缴费比例。但原则上最高缴费额不得超过职工平均工资的10%）
二）三险一金：
1、养老保险：个人缴纳工资基数的4%，企业缴纳工资基数的10%，个人缴费至法定正常退休年龄。
2、医疗保险：基本医疗保险个人缴纳工资基数的2%，单位缴纳工资基数的
9.8%其
0.8%部分进个人账户；大额医疗费用互助资金个人每月缴纳3元，单位缴纳工资基数的1%。个人生病时，由基本医疗保险统筹基金和个人帐户共同费用。超过基本医疗保险统筹基金起付标准，按照比例应当由个人负担的医疗费用。个人帐户不足支付部分由本人自付。
3、失业保险：个人缴纳工资基数的
0.5%，单位缴纳工资基数的
1.5%。按照规定参加失业保险，所在单位和本人已按规定履行缴费义务满1年的；非因本人意愿中断就业的；已办理失业登记，并有求职要求的，可领取失业保险。
4、住房公积金：个人缴纳工资基数的8%，单位缴纳工资基数的8%。个人购买、建造、翻建、大修自住住房；离休、退休的，完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的；户口迁出所在的市、县或者出境定居的；偿还购、贷款本息的；房租超出家庭工资收入的规定比例的可以提取住房公积金。