有一公司与我公司签订合同，委托我公司开垦荒地1000亩，每亩承包价1000元，中途该公司没钱支付工程款，我公司按合同规定收回土地继续做完工程，合同规定，对方原投入资金我方5年后分批予以偿还，偿还时，我们之间的债务怎样清算，我方投入的人工、管理费用是否可以扣除？谢谢。

根据《房地产管理法》第二十三条第一款的规定，划拨土地使用权人从国家手中取得划拨土地使用权时，未支付土地使用权出让金。相应地，划拨土地使用权人亦一般不能将该划拨土地使用权作为投资获利的工具。
既然划拨土地使用权一般不能用于投资，自然亦就无所谓投资收益或效益之说。同时，根据《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第47条规定，地方政府收回划拨土地使用权时，是无偿收回，只是对其地上建筑物、其他附着物，根据实际情况适当补偿。
即，在政府无偿收回划拨土地使用权情形下，原划拨土地使用权人并无所谓补偿款之外的投资效益。合作建设协议名为合作开发实为土地使用权转让，应认定无效。在已对协议效力作出否定性评价情况下，当事人不能再依协议中无效约定主张案涉项目利益。
即便案涉土地使用权升值亦系自然升值，而非因开发公司投资或劳动升值。土地使用权升值后，政府补贴对象亦系原划拨土地使用权人，开发公司非原土地使用权人，不能因签一无效合同而取得土地升值权益。
一般而言，房地产项目价值至少包括土地使用权价值和项目建设资金两大部分，本案项目总投资4亿元，并不包括案涉土地使用权本身的投资价值。双方在遗留协议中既未明确效益补偿的含义，又未就效益补偿给付时间及给付金额达成一致。
考虑到省总工会在遗留协议中确有承诺给予适当补偿，只是双方当事人对“适当补偿”的形式、计算方式、给付时间及金额等事项尚未达成一致，故对此不予处理，双方当事人可就适当补偿问题另行协商解决。
判决省总工会支付开发公司投入本金的相应利息补偿，以及实际支出补偿1400万余元。

土地补偿标准分为农村集体和国有土地二类： 　　
1.农村宅基地赔偿标准，依据我国土地法及土地法实施条例确定。可向当地国土资源部门咨询。 　　
2.国有土地的标准，参照当地国土部门公布的不同地类地价确定。 具体说来： 　　
(1)被征地的村或者村民小组建制撤销的，以及建制虽然不撤销，但不具备易地建房条件的，被拆迁人可以选择货币补偿，也可以选择与货币补偿金额问等价值的产权房屋调换。它的具体计算是(被拆拆除房屋建安重置单价结合成新+同区域新建多层商品住房每平方米建筑面积的土地使用权基价+价格补贴)×被拆除房屋的建筑面积; 　　
(2)被征地的村或者村民小组建制不撤销的，具备易地建房条件的，被拆迁人可以在乡(镇)土地利用总体规划确定的中心村或居民点范围内申请宅基地新建住房，并获得相应的货币补偿，计算公式为(被拆除房屋建安重置单价结合成新十价格补贴)×被拆除房屋的建筑面积;被拆迁人使用新宅基地所需的费用，由建设单位支付给被征地的村或者村民小组

建设工程施工合同具有下列情形之一的，应当根据合同法第五十二条第
(五)项的规定，认定无效：　　一承包人未取得建筑施工企业资质或者超越资质等级的;　　
二、没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义的;　　
三、建设工程必须进行招标而未招标或者中标无效的。　　建设工程施工合同无效，但建设工程经竣工验收合格，承包人请求参照合同约定支付工程价款的，应予支持。