女方要离婚，男方不肯，但结婚证在男方手里，两人已分居两年以上，有一孩子。请问该怎么办

1、向法院起诉离婚。
2、法院判决离婚的标准是夫妻感情是否确已破裂，如达到这一标准的，应会判离。如存在婚姻法第32条规定情形的，法院可据此判离。
3、离婚时分婚后财产，房改房属于共同财产，离婚时应分。婚后公积金、股份钱都属于共同财产。
4、判离时，孩子抚养有争议的，法院一般按如下处理：孩子未满两周岁时一般优先归母亲抚养，满两周岁法院将根据双方实际条件按对孩子成长有利的原则确定孩子归属，满十周岁法院还会征求孩子的意见。另一方按固定收入的20－30%支付抚养费，并有权探视。

关于孩子抚养权的问题，不是以个人意志为转移的，如果双方就孩子抚养权问题不能协议解决，那么可以通过诉讼的方式解决。法院会本着对孩子有利的原则进行审判。　以下是法院关于孩子抚养权判决的相关依据：　　
一、两周岁以下的子女，一般随母方生活，母方有下列情形之一的，可随父方生活：　　
(1)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的;　　
(2)有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的;　　
(3)因其他原因，子女确无法随母方生活的。　　
二、父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。　　
三、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：　　
(1)已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的;　　
(2)子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的;　　
(3)无其他子女，而另一方有其他子女的;　　
(4)子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。　　
四、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。　　
五、父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。　　六，在有利于保护子女利益的前提下，父母双方协议轮流抚养子女的，可行准许。

感情确实破裂了，可以去被告所在地的基层法院申请诉讼离婚感情破裂的标准：依据《婚姻法》规定如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
(一)、重婚或有配偶者与他人同居的。
所谓"有配偶者与他人同居"是指有配偶者与婚外异性，不以夫妻名义，持续、稳定地共同居住。如果以夫妻名义了，则构成重婚。 　　
(二)、实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的。
所谓"家庭暴力"，是指行为人以殴打、捆绑、残害、强行限制人身自由或者其他手段，给其家庭成员的身体、精神等方面造成一定伤害后果的行为。持续性、经常性的家庭暴力，构成虐待。
　　
(三)、有赌博、吸毒等恶习屡教不改的。 　　
(四)、因感情不合分居满两年的。
　 这种情况下，财产分割一般协商不了，法院会结合各种条件分割双方的财产，也包括房产，但是在分割房产时与谁提起离婚没有必然联系。