发行公司债券的程序是:向国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构报送公司营业执照;公司章程;公司债券募集办法;国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构规定的其他文件。证券交易所等可以审核公开发行证券申请,判断发行人是否符合发行条件、信息披露要求,督促发行人完善信息披露内容。
法律依据:《中华人民共和国证券法》第十六条
申请公开发行公司债券,应当向国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构报送下列文件:
(一)公司营业执照;
(二)公司章程;
(三)公司债券募集办法;
(四)国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构规定的其他文件。
依照本法规定聘请保荐人的,还应当报送保荐人出具的发行保荐书。