我们公司要我们交税，不管工资发多少，都要扣两点合理吗？

可以和老板协商处理，可以去劳动局投诉

双方约定即可。如果是未经协商，单方面扣的，可协商解决或经过诉讼解决

法律分析：企业员工发工资扣税是按照应纳税额=(工资薪金所得-“五险一金”-个税起征点)×适用税率-速算扣除数这一公式扣税的。个人所得税率是个人所得税税额与应纳税所得额之间的比例。
个人所得税率是由国家相应的法律法规规定的，根据个人的收入计算。 缴纳个人所得税是收入达到缴纳标准的公民应尽的义务。法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。