小产权房在离婚时,由双方协议分割使用权,协议不成的,由法院判决使用权。因为小产权房不能取得所有权,因此不能分割所有权,但可以处分使用权。对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的,人民法院不宜判决房屋所有权的归属,应当根据实际情况判决由当事人使用。法律依据:《最高人民法院关于适用〈中华人民
共和国民法典〉婚姻家庭编的解释(一)》第七十七条离婚时双方对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的,人民法院不宜判决房屋所有权的归属,应当根据实际情况判决由当事人使用。