我们结婚十几年了，有两个孩子，大的十一岁，小的七岁，没有结婚证但是户口在一起，受法律保护吗？

第一离婚是可以协议或者诉讼离婚的协商不成的则只能到对方户籍所在地或经常居住地（最近连续居住满一年以上的地方）的法院要求离婚：第二离婚一般需要解决两个问题，一是财产问题，婚后所取得的财产视为夫妻共同财产，一般平均分配，二是小孩抚养权问题，如有小孩，小孩的抚养权一般是根据有利于小孩的健康成长来判定；第三专业律师可以为你制定详细全面的应对策略避免在离婚的过程中所出现的法律风险争取更多的权益；

没有结婚生孩子当然是没有办理计划生育手续，属于违法生育，如果计划生育部门发现会处理。但和上户口是两回事。
现在公安部关于新生儿入户一般只需要孩子的出生证明，孩子父母的结婚证，身份证户口本即可以办理入户手续，不再计划生育等部门证明。
关于你没有结婚属于非婚生子女入户，需要提供申请人和入户人的亲子鉴定，凭鉴定结论入户，非婚生子女优亲子鉴定证明由公安机关指定鉴定机构鉴定后出具。

没有办结婚证债务可向法院提起诉讼，请求人民法院对同居期间的债务进行分割。
根据最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释（法释〔2001〕30号）：
第四条 男女双方根据婚姻法第八条规定补办结婚登记的，婚姻关系的效力从双方均符合婚姻法所规定的结婚的实质要件时起算。
第五条 未按婚姻法第八条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，起诉到人民法院要求离婚的，应当区别对待：
1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理；
1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记；未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。
最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释
(二)（法释[2003]19号）规定：
第一条　当事人起诉请求解除同居关系的，人民法院不予受理。但当事人请求解除的同居关系，属于婚姻法第三条、第三十二条、第四十六条规定的“有配偶者与他人同居”的，人民法院应当受理并依法予以解除。
当事人因同居期间财产分割或者子女抚养纠纷提起诉讼的，人民法院应当受理。