在一个小工厂上班，没有签劳动协议，做了半年，加班不给加班费，如果不加就扣工资，辞工还说要等一月，不然就扣好多工资严重的不给，我该怎么办

每月缴纳社保的费用在一个社保年度的期限内是固定不变的，不管有没有加班费，也不管加班费多少。如果单位缴纳社保的基数是按照劳动者上一年度平均工资来算的，那么上一年度的加班费会影响本年度的社保缴费基数的高低。
如果单位是按照当地的最低基数来缴纳的，那么社保缴费基数与劳动者的加班费没有任何关系。

根据《劳动合同法》第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：　　
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的;　　
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;　　
(三)安排加班不支付加班费的;　　
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。　　劳动法第四十四条规定：有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：　　
(一)安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬;　　
(二)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬;
(三)法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。　　如果用人单位安排劳动者加班，却不依据劳动法的上述规定支付加班工资的，属于违法行为，应当依法承担法律责任。　　准备劳动合同、加班证明等证明材料。　　如果没办法和用人单位协商解决的，可以向劳动监察大队投诉、向劳动仲裁委员会申请仲裁。

拖欠工资可以选择通过提起劳动仲裁维权。　　《劳动合同法》第八十五条　用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿;劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分;逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：　　
(一)未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的;　　
(二)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;　　
(三)安排加班不支付加班费的;　　
(四)解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。　　我国刑法第二百七十六条之一规定：以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动者的劳动报酬或者有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；造成严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。　　单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。　　有前两款行为，尚未造成严重后果，在提起公诉前支付劳动者的劳动报酬，并依法承担相应赔偿责任的，可以减轻或者免除处罚。