企业一月发放工资全是按应发工资打进存折，随后又要回一部分，也就是说实发放工资比应发工资少一部分，这种做法违反规定吗？职工明确提出解除劳动关系是不是能获得相对赔偿

劳动仲裁不会影响到您后续找工作的！员工与单位间存在纠纷是很常见的，这并不会影响到员工后续的职业发展的!公司无理由辞退员工，员工是可以申请经济补偿金的。
建立劳动关系后，双方当事人因劳动合同订立、履行、变更、解除发生争议，或者因为劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿等发生劳动纠纷，争议较大双方无法协商解决的，可以去劳动仲裁委员会申请仲裁，那么，就要确定劳动仲裁的流程。
实际中，发生劳动争议申请劳动仲裁时，要按照以下流程：
1、提交申请书
当事人申请劳动仲裁，应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。
2、申请被受理
仲裁委员会在收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的决定，决定受理的，在作出决定之日起五日内会将申诉书副本送达被申请人。
3、开庭审理
仲裁庭在开庭的五日前，会将开庭日期、地点书面通知双方当事人。
注意，对无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，申请人会被撤诉自理，被申请人会被做缺席裁决。
4、仲裁调解
仲裁庭处理劳动争议会先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。调解能达成协议的，仲裁庭根据协议内容制作调解书，反之，仲裁庭会及时裁决。
5、仲裁裁决
仲裁庭裁决劳动争议案件，会在劳动仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。