在公司，员工有时加班12小时，加上通常的上班时间，一天连续20小时上班，不能说是缺勤

工资是劳动者的合法收入，无论什么原因，用人单位无权扣除或者扣押劳动者的工资。
用人单位开除员工，须将劳动者的工资结清。除了给正常的出勤工资，每工作满一年需要给一个月的基本工资，不足一年、满半年的按半个月计算。
法律依据：《工资支付暂行规定》第16条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。因此，如果用人单位和劳动者在劳动合同中约定了劳动者的赔偿责任，用人单位可以依约定要求劳动者赔偿。
如果用人单位和劳动者在劳动合同中没有约定劳动者的赔偿责任，劳动者给用人单位造成了经济损失，用人单位能否要求其赔偿，法律法规没有明确规定。在这种情形下，用人单位不能要求劳动者赔偿。
理由是：①劳动者和用人单位之间是劳动关系，不是民事权利义务关系，不适用民法的归责原则；②除了《劳动合同法》规定的二种情形外，用人单位是否享有向劳动者索赔的权利取决于双方的约定，如果没有约定，应当视为用人单位对该项权利的放弃；③在我国，立法者的本意是限制用人单位向劳动者索赔的权利。