大学和雇主签订了三方协议，毕业后也来到雇主工作，现在工作一年，但是当签订三方协议时，如果有违约付款，但现在我想辞职，不是违约。

按实际情况及相关的法律规定，只有约定的违约金符合法律规定的，才受到法律保护，否则可以拒绝承担违约金。
　　《中华人民共和国劳动合同法》　第二十二条　用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
　　劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
　　用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
　　第二十三条　用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
　　对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
　　第二十四条　竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员。竞业限制的范围、地域、期限由用人单位与劳动者约定，竞业限制的约定不得违反法律、法规的规定。
　　在解除或者终止劳动合同后，前款规定的人员到与本单位生产或者经营同类产品、从事同类业务的有竞争关系的其他用人单位，或者自己开业生产或者经营同类产品、从事同类业务的竞业限制期限，不得超过二年。

根据《劳动合同法》第7条规定，劳动者与用人单位之间的劳动关系自实际用工之日起建立。用人单位应该自实际用工之日起一个月之内与劳动者签订书面劳动合同。虽然你没有与单位签订书面的劳动合同，但你已经与公司建立了劳动关系，合法的劳动关系应当受到法律的保护；根据《劳动合同法》第82条规定，用人单位自实际用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资，但该主张有1年的时效限制。
按月依法及时足额地支付劳动者的工资是用人单位的法定职责；公司拒不支付工资的行为是违法的，您可以要单位予以支付。

劳动者辞职的，如果用人单位为劳动者提供专项培训的，并且与劳动者约定服务期，劳动者违反服务期约定的，是应当支付用人单位违约金。
在劳动仲裁中，用人单位应当就产生的专项服务费进行举证，如果没有证据，将不会得到支持。
违约金的数额按照未履行完的服务期的比例支付。