案件对方在公安和检察机关鉴定的结果是重伤二级，拘留了我方一年半，案件交给法院时，我方再次申请鉴定。 结果是轻微的伤口，但事件已经半年了。 去了法院，我们确认了该怎么办

根据国务院《诉讼费用交纳办法》的规定，在法院诉讼中，当事人申请进行伤残鉴定的，应由鉴定的申请人向司法鉴定机构预付相应的伤残司法鉴定费用。之后，再根据法院判决情况，由败诉方来承担；如果部分胜诉、部分败诉的，人民法院根据案件的具体情况决定当事人各自负担的诉讼费用数额。

《诉讼费用交纳办法》
第六条　当事人应当向人民法院交纳的诉讼费用包括：
（一）案件受理费；
（二）申请费；
（三）证人、鉴定人、翻译人员、理算人员在人民法院指定日期出庭发生的交通费、住宿费、生活费和误工补贴。

第十二条　诉讼过程中因鉴定、公告、勘验、翻译、评估、拍卖、变卖、仓储、保管、运输、船舶监管等发生的依法应当由当事人负担的费用，人民法院根据谁主张、谁负担的原则，决定由当事人直接支付给有关机构或者单位，人民法院不得代收代付。
　　
人民法院依照民事诉讼法第十一条第三款规定提供当地民族通用语言、文字翻译的，不收取费用。

第二十九条　诉讼费用由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。
　　
部分胜诉、部分败诉的，人民法院根据案件的具体情况决定当事人各自负担的诉讼费用数额。
　　
共同诉讼当事人败诉的，人民法院根据其对诉讼标的的利害关系，决定当事人各自负担的诉讼费用数额。

轻微伤，属于治安案件，而轻伤则属于刑事案件了，构成刑事案件，依法就要追究刑事责任。现在，公安机关可以先立行政案件，进行先期侦查。法律链接：《公安机关办理行政案件程序规定》第五十一条　对发现或者受理的案件暂时无法确定为刑事案件或者行政案件的，可以按照行政案件的程序办理。
在办理过程中，认为涉嫌构成犯罪的，应当按照《公安机关办理刑事案件程序规定》办理。

申请伤情鉴定：
1、如果鉴定为轻伤或重伤，打人者涉嫌故意伤害罪，依法应被追究刑事责任和赔偿责任。
2、如果鉴定为轻微伤，可起诉要求民事赔偿，同时可以要求给予行政处罚（即拘留）。
3、公安机关立案后，受害者还可以提起刑事附带民事诉讼，也可直接向法院起诉要求人身损害赔偿。
4、人身损害赔偿项目包括：医疗费、护理费、误工费、住院伙食补助费、营养费、交通费、伤残赔偿金、精神损害抚慰金等。