我是2010的应届毕业生，最后下半年外出实习时老师未与我们商量就在网上与单位给我们签了网上就业协议。现在我已经离职不干了，单位以未缴纳违约金为由扣押我们的档案，请问我应该怎么办？

只有经过专业技术培训的，才需要缴纳违约金，违约金数额为不高于尚未履行期间分摊的培训费。
根据《劳动合同法》第二十五条规定，只有以下两种情况，用人单位可以劳动者约定违约金：
1、按《劳动合同法》第二十二条规定，用人单位对劳动者进行了专业技术培训（不是岗前职业培训），支付了培训费，可以在劳动合同或者培训协议中约定服务期，劳动者违反服务期约定的，应当向用人单位支付违约金。
但违约金的数额不得超过尚未履行期间分摊的培训费用。
2、按《劳动合同法》第二十三条、二十四天规定，用人单位可以与高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员，在劳动合同或者保密协议中约定保密事项和竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。
劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
劳动者辞职解除合同的，只有上述第1种情形。但按《劳动合同法实施条例》第二十六条规定，即使用人单位支付了培训费，对劳动者进行了专业技术培训，约定了服务期的，劳动者依照《劳动合同法》第三十八条规定解除合同的，不属于违反服务期约定，无需支付违约金。

员工离职需要按照法律规定提前通知单位，如果员工违法提前离职，那么单位是可以扣除员工部分奖励性待遇作为处罚，但是工资需要支付，如果以此和单位出现纠纷是可以申请劳动仲裁进行维权的。依据《工资支付暂行条例》第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。　　第十八条各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。　　第十九条劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。《劳动争议调解仲裁法》第二条中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
（一）因确认劳动关系发生的争议；
（二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；
（三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；
（四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；
（五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；
（六）法律、法规规定的其他劳动争议。

《合同法》第七章违约责任：
第一百零七条　当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第一百零八条　当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满之前要求其承担违约责任。
第一百零九条　当事人一方未支付价款或者报酬的，对方可以要求其支付价款或者报酬。
第一百一十条　当事人一方不履行非金钱债务或者履行非金钱债务不符合约定的，对方可以要求履行，但有下列情形之一的除外：
（一）法律上或者事实上不能履行；
（二）债务的标的不适于强制履行或者履行费用过高；
（三）债权人在合理期限内未要求履行。