已按首诊诊断认定工伤，如何申请治疗中并发疾病工伤认定？

工伤认定一般由市劳动保障行政部门负责，对认定不服的既可以向市劳动保障行政部门的上一级主管部门即该省劳动保障厅(局)申请复议，也可以向市劳动保障行政部门所属的该市人民政府申请复议。当然，申请人不得同时向该省劳动保障厅(局)和该市人民政府提出复议申请。
根据《社会保险行政争议处理办法》的现定，对经办机构核定其工伤保险待遇标准有异议的，可以直接向管理该经办机构的劳动保障行政部门申请行政复议，也可以先向作出该具体行政行为的经办机构申请复查，对复查决定不服，再向劳动保障行政部门申请行政复议。

工伤认定申请表应当包括事故发生的时间、地点、原因以及职工伤害程度等基本情况。工伤认定申请人提供材料不完整的，社会保险行政部门应当一次性书面告知工伤认定申请人需要补正的全部材料。
申请人按照书面告知要求补正材料后，社会保险行政部门应当受理。

申请工伤认定需要去你单位所在地的劳动部门。

根据《工伤保险条例》第十七条之规定，用人单位应在事故伤害发生之日起30日内，为职工申请工伤认定，如单位不给职工申请的，工伤职工在事故伤害发生之日起1年内，自己到单位所在地劳动部门申请工伤认定。
因为各地区在具体操作上有所不同，所以建议你在申请前拨打12333咨询一下当地劳动部门。。有工伤赔偿争议的，可向仲裁机构申请仲裁进行工伤索赔。

工伤报告程序
用人单位为劳动者在工伤保险机构投了工伤保险的才有这个程序。
单位应当自工伤事故发生之日或者职业病确诊之日起15日内，向当地劳动行政部门提出工伤报告。
二、工伤认定程序
由社会保险经办机构对工伤(亡)事故进行调查确定是否属工伤的程序，这是一般工伤必走第一步。
但用人单位书面认可为工伤的，又没有投工伤保险的情况下，可以不走这一程序。
注意工伤认定的两个时间：单位没有提起工伤认定的，工伤者一定要在事故发生之日起一年内向劳动部门提出申请。
社保经办机构调查认定后，书面通知单位及伤者。
三、工伤鉴定程序
工伤鉴定是在申请工伤鉴定的职工被认定为工伤的基础上(即走完工伤认定程序后)，在其医疗终结或医疗期满之后，由县以上劳动鉴定委员会对其进行的评定伤残等级的行为。
广义的工伤鉴定包括劳动能力鉴定和致残等级鉴定。窄义的工伤鉴定指致残等级鉴定。
四、协商赔偿程序
工伤鉴定以后，就可以依据鉴定的标准计算出赔偿数额了。单位投了工伤保险的，就直接由国家工伤保险机构依据标准发放工伤保险待遇。
没有投保的(特指在工伤保险机构投保)，则依据标准与用人单位协商解决
五、劳动仲裁程序
与用人单位协商解决不了的，则可以依据劳动仲裁法规提起仲裁程序。
六、法院审理程序
对劳动仲裁不服的，可以向法院提起诉讼解决。
对一审法院判决不服的，可以依法向二审法院提起上诉。
七、执行程序
仲裁或者判决生效后，用人单位不支付赔偿费的，则可以依据生效法律文书向法院执行局提起执行申请，由法院执行。