我在公司请假，但算我旷工，要扣1000元，合法吗？

这种是不合法的。旷工是指员工请假没有获得批准或没有履行请假手续而未到岗上班的行为。对于旷工员工的处理方式，除了一般的行政处分与解除劳动合同之外，还有一些单位会采用扣工资的方式，但扣三天的工资显然是不合法的。法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

法律分析：这种是不合法的。旷工是指员工请假没有获得批准或没有履行请假手续而未到岗上班的行为。对于旷工员工的处理方式，除了一般的行政处分与解除劳动合同之外，还有一些单位会采用扣工资的方式，但扣三天的工资显然是不合法的。法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

这在法律上并无规定。员工旷工三天，虽不能算自动离职，不过单位是可以按照公司的规章制度辞退员工的，并且单位可以扣除员工部分奖励性待遇作为处罚，但是不得克扣员工工资。
连续旷工几天可以解除劳动关系，这个要有公司自身的规章制度才可以被仲裁接受和认定。并且，公司需要举证证明这个规章制度已经送达给了员工本人。 另外，旷工的事实，还要单位证明确实已经通知到了劳动者，发短信，发邮件还不够，应当再发书面的通知，留存快递底单，查询快递送达记录等等。

扩展资料：
根据法律规定单位不得随意克扣员工工资。若存在单位克扣员工工资的现象，员工可以向劳动监察大队投诉或者申请劳动仲裁进行维权。法律依据：《劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。“
《工资支付暂行条例》第九条：“ 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。”
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国劳动法
参考资料来源：百度百科-中华人民共和国劳动合同法
参考资料来源：百度百科-工资支付暂行条例